Variant report

Variant	rs6818817
Chromosome Location	chr4:46896902-46896903
allele	C/G
Outlinks	Ensembl UCSC

Chromatin state
Related regulatory elements
Target genes
Other information

No.	Transcrition factor	Chromosome Location	Cell Line	Cell type	Cell Stage	Matched TF binding sites
1	CEBPB	chr4:46896872-46897186	HepG2	liver:	n/a	chr4:46897015-46897026
2	GATA3	chr4:46896822-46897139	SH-SY5Y	brain:	n/a	n/a
3	CEBPB	chr4:46896867-46897211	K562	blood:	n/a	chr4:46897015-46897026

Variant related genes	Relation type
COX7B2	TF binding region

Extended variants
information (count: 56 )
Associated
traits (count: 0)

rSNPs within LD-proxies of this variant (count:56)

rs_ID	r²[population]
rs10004131	0.92[AMR][1000 genomes];0.84[EUR][1000 genomes]
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No data

Chromatin state (count:1 , 50 per page) page: 1

No.	Chromosome Location	Chromatin state	Cell line	Tissue
1	chr4:46896800-46897200	Enhancers	Primary hematopoietic stem cells G-CSF-mobilized Male	--

The 2.0 version of rSNPBase

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