Variant report

Variant	rs10005846
Chromosome Location	chr4:174275513-174275514
allele	C/T
Outlinks	Ensembl UCSC

Chromatin state
Related regulatory elements
Target genes
Other information

No.	Distal block	Cell Line	Cell type
1	chr4:174266584..174269438-chr4:174273432..174276469,3	K562	blood:
2	chr4:174266584..174269438-chr4:174273432..174276469,4	K562	blood:
3	chr4:174253509..174260345-chr4:174271547..174278319,12	K562	blood:
4	chr4:174266783..174269707-chr4:174275143..174277919,2	MCF-7	breast:

Variant related genes	Relation type
ENSG00000164104	Chromatin interaction

Extended variants
information (count: 43 )
Associated
traits (count: 0)

rSNPs within LD-proxies of this variant (count:43)

rs_ID	r²[population]
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rs965932	1.00[CEU][hapmap];1.00[CHB][hapmap];0.90[CHD][hapmap];1.00[GIH][hapmap];1.00[JPT][hapmap];1.00[MEX][hapmap];1.00[TSI][hapmap];0.89[YRI][hapmap];0.87[EUR][1000 genomes];1.00[ASN][1000 genomes]
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No data

Chromatin state (count:3 , 50 per page) page: 1

No.	Chromosome Location	Chromatin state	Cell line	Tissue
1	chr4:174256800-174280400	Weak transcription	Aorta	Aorta
2	chr4:174259200-174290400	Weak transcription	Thymus	Thymus
3	chr4:174265400-174278200	Weak transcription	Ovary	ovary

The 2.0 version of rSNPBase

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